中央气象台6月13日06时继续发布暴雨黄色预警：预计，6月13日08时至14日08时，广西南部、广东中南部、海南岛、福建东部、浙江东部、台湾岛等地部分地区有大到暴雨，其中，海南岛南部、台湾岛南部等地部分地区有大暴雨，局地特大暴雨（250～400毫米）。上述部分地区伴有短时强降水（最大小时降雨量20～50毫米，局地可超过70毫米），局地有雷暴大风等强对流天气。

据民航局空管局气象中心提供的信息显示，受台风“蝴蝶”外围环流的影响，华南、华东南部有中到强雷雨，局地有8级以上大风。受影响的主要机场有：海口美兰、三亚凤凰、广州白云、深圳宝安、珠海金湾、南宁吴圩、厦门高崎等。其中海口美兰机场最大阵风可达9-10级，三亚凤凰机场最大阵风可达10-11级。